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Grant: Discovery Grants Program - Individual

Université du Québec à Rimouski

$33,000.00

Plasticité phénotypique, mémoire épigénétique et réponse au stress

FY 2019-20

Summary
La capacité des organismes à répondre rapidement aux changements de l'environnement dépend de la variabilité génétique présente au sein des populations ainsi que de leur plasticité phénotypique. Un mécanisme fondamental de la plasticité phénotypique, au niveau moléculaire, est la sur-expression ou la sous-expression des gènes impliqués dans les processus de régulation ou dans l'expression des traits fonctionnels. Cette flexibilité pourrait être largement médiée par les processus épigénétiques tels que la méthylation de l'ADN. Le stress environnemental peut entrainer des changements de méthylation, ce qui peut avoir des conséquences évolutives importantes malgré une absence de variation des séquences d'ADN. Nous ne savons toutefois pas dans quelle mesure ces changements dans la méthylation de l'ADN induits par l'environnement sont transmis aux descendants et si ils sont vraiment indépendants de la variation génétique entre les individus. Pour s'attaquer à cette question, l'étude d'organismes asexués peut être extrêmement puissante car elle permet de séparer les effets génétiques des effets épigénétiques. Cette proposition fait appel à une espèce clé des écosystèmes d'eau douce, le microcrustacé Daphnia pulex qui se reproduit de façon clonale. Les objectifs spécifiques de cette proposition seront de déterminer : 1) si la plasticité phénotypique intragénérationnelle est liée à un plus grand registre d'expression génique et épigénétique, 2) si l'exposition à un stresseur environnemental à la génération parentale modifie le phénotype des descendants des générations successives et est accompagné de modifications épigénétiques, 3) si les stress du passé s'inscrivent dans la mémoire épigénétique permettant ainsi une variation temporelle des réponses à ces stresseurs et 4) si les épimutations qui s'accumulent sur les lignées clonales sont stables et influencent l'adaptation à long-terme. Le modèle daphnies offre donc une opportunité unique d'explorer comment la sélection naturelle module les liens entre l'expression génique et le phénotype à l'intérieur et entre les générations, ce qui est en lien direct avec mon programme de recherche portant sur la plasticité génomique et le potentiel évolutif. Nos résultats ouvriront la voie au nouveau domaine de l'épigénétique écologique et assureront une compréhension plus fine des mécanismes permettant une évolution rapide dans des environnements changeants.
Program
Discovery Grants Program - Individual
Location
Quebec, Canada
Recipient Type
Academia
Type
Grant
Source
NSERC's Awards Data

As published

Application id
RGPIN-2018-06349
Name nom
Dufresne, France
Department département
Biologie, chimie et géographie
Organization id
58
Institution établissement
Université du Québec à Rimouski
Province en
Québec
Province fr
Québec
Country en
CANADA
Country fr
CANADA
Fiscal year exercice financier
2019
Competition year année de concours
2018
Award amount
33000
Program id
RGPIN
Program name en
Discovery Grants Program - Individual
Program name fr
Programme de subventions à la découverte - individuelles
Group en
DISCOVERY RESEARCH
Group fr
RECHERCHE AXÉE SUR LA DÉCOUVERTE
Committee code
1502
Committee name en
Biological Systems and Functions
Committee name fr
Systèmes et fonctions biologiques
Area of application code
407
Area of application group en
Environment
Area of application group fr
Environnement
Area of application en
Conservation and preservation
Area of application fr
Conservation et préservation
Research subject code
5005
Research subject group en
Genetics
Research subject group fr
Génétique
Research subject en
Evolutionary genetics
Research subject fr
Génétique évolutive
Installment
inst:2 - 5
Partie
2
Nb partie
5
Application title
Plasticité phénotypique, mémoire épigénétique et réponse au stress
Keyword
NSERC
Application summary
La capacité des organismes à répondre rapidement aux changements de l'environnement dépend de la variabilité génétique présente au sein des populations ainsi que de leur plasticité phénotypique. Un mécanisme fondamental de la plasticité phénotypique, au niveau moléculaire, est la sur-expression ou la sous-expression des gènes impliqués dans les processus de régulation ou dans l'expression des traits fonctionnels. Cette flexibilité pourrait être largement médiée par les processus épigénétiques tels que la méthylation de l'ADN. Le stress environnemental peut entrainer des changements de méthylation, ce qui peut avoir des conséquences évolutives importantes malgré une absence de variation des séquences d'ADN. Nous ne savons toutefois pas dans quelle mesure ces changements dans la méthylation de l'ADN induits par l'environnement sont transmis aux descendants et si ils sont vraiment indépendants de la variation génétique entre les individus. Pour s'attaquer à cette question, l'étude d'organismes asexués peut être extrêmement puissante car elle permet de séparer les effets génétiques des effets épigénétiques. Cette proposition fait appel à une espèce clé des écosystèmes d'eau douce, le microcrustacé Daphnia pulex qui se reproduit de façon clonale. Les objectifs spécifiques de cette proposition seront de déterminer : 1) si la plasticité phénotypique intragénérationnelle est liée à un plus grand registre d'expression génique et épigénétique, 2) si l'exposition à un stresseur environnemental à la génération parentale modifie le phénotype des descendants des générations successives et est accompagné de modifications épigénétiques, 3) si les stress du passé s'inscrivent dans la mémoire épigénétique permettant ainsi une variation temporelle des réponses à ces stresseurs et 4) si les épimutations qui s'accumulent sur les lignées clonales sont stables et influencent l'adaptation à long-terme. Le modèle daphnies offre donc une opportunité unique d'explorer comment la sélection naturelle module les liens entre l'expression génique et le phénotype à l'intérieur et entre les générations, ce qui est en lien direct avec mon programme de recherche portant sur la plasticité génomique et le potentiel évolutif. Nos résultats ouvriront la voie au nouveau domaine de l'épigénétique écologique et assureront une compréhension plus fine des mécanismes permettant une évolution rapide dans des environnements changeants.
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