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Grant: Travel Awards - Institute Community Support

Université de Sherbrooke

$1,500.00

Extension de l'annotation et caractérisation fonctionnelle des snoRNA avec l'aide d'une meilleure méthodologie de séquençage d'ARN sur des tissus humains.

EF 2018-19

Résumé
Les petits ARN nucléolaires (snoRNA) sont un groupe de molécules nécessaires à effectuer des modifications chimiques importantes au fonctionnement et à la survie des cellules. Plusieurs publications mettent en évidence que l'abondance des snoRNA diffère fortement d'un type cellulaire à un autre et qu'une dérégulation de l'expression de certains d'entre eux est au cœur de différentes maladies dont certains types de cancers, le syndrome de Prader-Willi et même l'asthme. Le séquençage d'ARN, une méthode typiquement utilisée pour évaluer l'abondance des ARN, est cependant biaisée dans sa détection des snoRNA dû à des particularités structurales de ces molécules. Nos précédents projets nous ont amenés à établir une méthodologie de séquençage réduisant ces biais de détection nous permettant ainsi de faire une estimation réaliste de l'abondance des snoRNA. Cette même méthodologie nous a également amené à découvrir de nouveaux snoRNA et nous nous attendons donc à en découvrir davantage avec plus d'expériences de séquençage. À travers mon projet de doctorat, je veux séquencer plusieurs tissus normaux avec cette nouvelle technique afin de cataloguer l'ensemble des snoRNA ainsi que d'établir leur niveau d'expression à travers le corps humain. L'analyse subséquente des relations d'abondance entre les différents types de snoRNA et celle d'autres ARN me permettra d'avancer la caractérisation fonctionnelle des snoRNA, qui reste particulièrement incomplète à ce jour. Ce projet permettra ainsi d'étendre l'annotation du transcriptome humain, d'avancer les connaissances limitées sur la fonction des snoRNA et d'offrir une référence d'expression tissulaire des snoRNA. J'espère ainsi pouvoir aider la communauté scientifique à développer de meilleures méthodes de détection et à comprendre les causes moléculaires de certaines pathologies, dont le cancer.
Programme
Travel Awards - Institute Community Support
Emplacement
Quebec, Canada
Type de bénéficiaire
Academia
Type
Grant
Source
CIHR Funding Decisions Database

Tel que publié

Id
400311
Name
Boivin Vincent
Region
Québec
Country
Canada
Orgtype
Institution Paid; Research Institution
Instname2
Genetics
Theme2
Biomedical
Prcname2
Institute of Cancer Research
Projecttitle
Extension de l'annotation et caractérisation fonctionnelle des snoRNA avec l'aide d'une meilleure méthodologie de séquençage d'ARN sur des tissus humains.
Programtype2
Undefined
Orgnameinp2
Université de Sherbrooke
Cihramount2
$1,500
Cihrequipment2
$0
Programname2
Travel Awards - Institute Community Support
Keyworddelim
Arn; Bio-Informatique; Génétique; Non-Codant; Rna-Seq; Snorna; Séquençage; Transcriptomique
Abstract
Les petits ARN nucléolaires (snoRNA) sont un groupe de molécules nécessaires à effectuer des modifications chimiques importantes au fonctionnement et à la survie des cellules. Plusieurs publications mettent en évidence que l'abondance des snoRNA diffère fortement d'un type cellulaire à un autre et qu'une dérégulation de l'expression de certains d'entre eux est au cœur de différentes maladies dont certains types de cancers, le syndrome de Prader-Willi et même l'asthme. Le séquençage d'ARN, une méthode typiquement utilisée pour évaluer l'abondance des ARN, est cependant biaisée dans sa détection des snoRNA dû à des particularités structurales de ces molécules. Nos précédents projets nous ont amenés à établir une méthodologie de séquençage réduisant ces biais de détection nous permettant ainsi de faire une estimation réaliste de l'abondance des snoRNA. Cette même méthodologie nous a également amené à découvrir de nouveaux snoRNA et nous nous attendons donc à en découvrir davantage avec plus d'expériences de séquençage. À travers mon projet de doctorat, je veux séquencer plusieurs tissus normaux avec cette nouvelle technique afin de cataloguer l'ensemble des snoRNA ainsi que d'établir leur niveau d'expression à travers le corps humain. L'analyse subséquente des relations d'abondance entre les différents types de snoRNA et celle d'autres ARN me permettra d'avancer la caractérisation fonctionnelle des snoRNA, qui reste particulièrement incomplète à ce jour. Ce projet permettra ainsi d'étendre l'annotation du transcriptome humain, d'avancer les connaissances limitées sur la fonction des snoRNA et d'offrir une référence d'expression tissulaire des snoRNA. J'espère ainsi pouvoir aider la communauté scientifique à développer de meilleures méthodes de détection et à comprendre les causes moléculaires de certaines pathologies, dont le cancer.
Competitiondate
201901
Approvedterm2
1 yr 0 mth
Pinamesdelim
Boivin, Vincent
Approvedterm
1 an 0 mois
Cihrcontribution2
Inst of Cancer Research~ $1,500~ $0~