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Grant: Alliance Grants

Université du Québec à Montréal

$45,000.00

Améliorer la résilience des plantes aux températures élevées via une approche intégrée de modulation des réseaux de régulation génétique

EF 2023-24

Résumé
L'urgence liée aux changements climatiques impose l'utilisation d'approches rationnelles et ciblées qui combinent les données et les méthodes de la biologie des systèmes, de la génomique et de la biotechnologie, afin de produire des variétés de plantes mieux adaptées à la réalité climatique présente et future. Ces approches nécessitent toutefois une connaissance fine de la réponse des plantes aux stress environnementaux. Cette réponse est en effet complexe et dépend de réseaux de régulation génétique (RRG) qui sont perçus comme des cibles de choix pour augmenter la résilience des plantes aux stress environnementaux. Les RRG dépendent de l'interaction entre des facteurs protéiques, comme les facteurs de transcription, et l'ADN qui modulent l'activité génique et déterminent les caractéristiques phénotypiques ou agronomiques des plantes. Plusieurs facteurs influencent ces RRG en condition de stress comme des changements dans les patrons d'interactions protéine-protéine ainsi que des changements dans les modifications post-traductionnelles (MPT) des protéines. En particulier, la SUMOylation est une MPT qui permet d'altérer rapidement les propriétés (localisation, stabilité, interactions) de nombreuses protéines suite à des stress environnementaux comme le stress de haute température (HT). En revanche, la contribution exacte de la SUMOylation à la régulation des RRG des plantes est encore largement inconnue, ce qui limite les possibilités d'interventions et d'amélioration. Ce projet vise ainsi à déterminer la contribution de la SUMOylation à la régulation des RRG à l'échelle pan-génomique. Cette étude - menée par trois experts des domaines complémentaires de la biologie des systèmes, de la génomique fonctionnelle, et des MPT - permettra d'étendre et de diversifier le catalogue de cibles génétiques pour améliorer la résilience des plantes aux stress environnementaux. Par l'intégration de données multimodales, l'élucidation des RRG et la validation des acteurs principaux de la réponse au stress de HT, nous ouvrirons la voie à des utilisations biotechnologiques qui permettront à l'agriculture québécoise et canadienne de mieux résister aux vagues de chaleur liées aux changements climatiques.
Programme
Alliance Grants
Emplacement
Quebec, Canada
Type de bénéficiaire
Academia
Type
Grant
Source
NSERC's Awards Data

Tel que publié

Application id
577082-2022
Name nom
Cappadocia, Laurent L
Department département
Chimie
Organization id
57
Institution établissement
Université du Québec à Montréal
Province en
Québec
Province fr
Québec
Country en
CANADA
Country fr
CANADA
Fiscal year exercice financier
2023
Competition year année de concours
2022
Award amount
45000
Program id
ALLRP
Program name en
Alliance Grants
Program name fr
Subventions Alliance
Group en
RESEARCH PARTNERSHIPS
Group fr
PARTENARIATS DE RECHERCHE
Committee code
96
Committee name en
RPP Internal Decision Cttee
Committee name fr
Cté de décision interne - PPR
Area of application code
100
Area of application group en
Agriculture and primary food production
Area of application group fr
Agriculture et produits alimentaires primaires
Area of application en
Agriculture and primary food production
Area of application fr
Agriculture et produits alimentaires primaires
Research subject code
4908
Research subject group en
Plant and treebiology
Research subject group fr
Crop and pasture production,breeding
Research subject en
Biologie végétale et des arbres
Research subject fr
Production et amélioration génétique des cultures
Application title
Améliorer la résilience des plantes aux températures élevées via une approche intégrée de modulation des réseaux de régulation génétique
Keyword
bioinformatique; biologie des systèmes/intégrative; biotechnologie végétale; changements climatiques; études structure-fonction; génomique et régulation génétique; ingénierie des protéines; modifications post-traductionnelles; SUMO E3 ligases; SUMOylation
Application summary
L'urgence liée aux changements climatiques impose l'utilisation d'approches rationnelles et ciblées qui combinent les données et les méthodes de la biologie des systèmes, de la génomique et de la biotechnologie, afin de produire des variétés de plantes mieux adaptées à la réalité climatique présente et future. Ces approches nécessitent toutefois une connaissance fine de la réponse des plantes aux stress environnementaux. Cette réponse est en effet complexe et dépend de réseaux de régulation génétique (RRG) qui sont perçus comme des cibles de choix pour augmenter la résilience des plantes aux stress environnementaux. Les RRG dépendent de l'interaction entre des facteurs protéiques, comme les facteurs de transcription, et l'ADN qui modulent l'activité génique et déterminent les caractéristiques phénotypiques ou agronomiques des plantes. Plusieurs facteurs influencent ces RRG en condition de stress comme des changements dans les patrons d'interactions protéine-protéine ainsi que des changements dans les modifications post-traductionnelles (MPT) des protéines. En particulier, la SUMOylation est une MPT qui permet d'altérer rapidement les propriétés (localisation, stabilité, interactions) de nombreuses protéines suite à des stress environnementaux comme le stress de haute température (HT). En revanche, la contribution exacte de la SUMOylation à la régulation des RRG des plantes est encore largement inconnue, ce qui limite les possibilités d'interventions et d'amélioration. Ce projet vise ainsi à déterminer la contribution de la SUMOylation à la régulation des RRG à l'échelle pan-génomique. Cette étude - menée par trois experts des domaines complémentaires de la biologie des systèmes, de la génomique fonctionnelle, et des MPT - permettra d'étendre et de diversifier le catalogue de cibles génétiques pour améliorer la résilience des plantes aux stress environnementaux. Par l'intégration de données multimodales, l'élucidation des RRG et la validation des acteurs principaux de la réponse au stress de HT, nous ouvrirons la voie à des utilisations biotechnologiques qui permettront à l'agriculture québécoise et canadienne de mieux résister aux vagues de chaleur liées aux changements climatiques.