Grant: Alliance Grants

The partnership at the core of this proposal is an ongoing collaboration between scientists at Sanofi and York University, Toronto aimed at investigating the detection of virus infected cultured cells. Sanofi at the Toronto site is one of Canada's largest vaccine manufacturers with over $2B in new infrastructure investments since 2018. The Toronto site is also home to Sanofi's North American Centre of Excellence for Analytical Sciences and Bioprocess R&D. Detection of virus infected cells is crucial since vaccine's are produced in specific cell types grown in the laboratory in rigorously controlled aseptic conditions. The cells must be carefully monitored since infection with unknown pathogens (eg viruses) could seriously compromise the safety of the vaccines that are produced in the cells. Therefore, achieving the most robust, state of the art detection methods for viral infection of cultured cells is a cornerstone of safe vaccine production, as well as being critical for reliable fundamental discovery research, which is paramount for public health in Canada. Currently it is very challenging to screen cell cultures for unknown viral pathogens because of their heterogeneity. In this proposal we will pursue an unbiased genomic approach based on next generation sequencing that will allow robust detection of viral pathogens using state of the art gene sequencing methods. Identified methods of viral detection will then be incorporated into routine cell monitoring for vaccine production at Sanofi. We anticipate that that strategy will provide a new standard for safe vaccine production in Canada. Le partenariat au coeur de cette proposition est une collaboration continue entre des scientifiques de Sanofi et de l'Université York de Toronto visant à étudier la détection de cellules en culture infectées par des virus. Sanofi sur le site de Toronto est l'un des plus grands fabricants de vaccins au Canada avec plus de $2B dollars d'investissements dans de nouvelles infrastructures depuis 2018. Le site de Toronto abrite également le Centre d'excellence nord-américain de Sanofi pour les sciences analytiques et la R&D sur les bioprocédés. La détection des cellules infectées par le virus est cruciale car les vaccins sont produits dans des types cellulaires spécifiques cultivés en laboratoire dans des conditions aseptiques rigoureusement contrôlées. Les cellules doivent être soigneusement surveillées car une infection par des agents pathogènes inconnus (par exemple des virus) pourrait sérieusement compromettre la sécurité des vaccins produits dans les cellules. Par conséquent, l'obtention des méthodes de détection les plus robustes et à la fine pointe de la technologie pour l'infection virale des cellules en culture est la pierre angulaire de la production de vaccins sécuritaires, en plus d'être essentielle pour une recherche de découverte fondamentale fiable, qui est primordiale pour la santé publique au Canada. Actuellement, il est très difficile de cribler des cultures cellulaires pour des agents pathogènes viraux inconnus en raison de leur hétérogénéité. Dans cette proposition, nous poursuivrons une approche génomique impartiale basée sur le séquençage de nouvelle génération qui permettra une détection robuste des agents pathogènes viraux à l'aide de méthodes de séquençage de gènes de pointe. Les méthodes identifiées de détection virale seront ensuite intégrées à la surveillance cellulaire de routine pour la production de vaccins chez Sanofi. Nous prévoyons que cette stratégie fournira une nouvelle norme pour la production sécuritaire de vaccins au Canada.