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Grant: Research Tools and Instruments - Category 1 (<$150,000)

Université du Québec à Rimouski

$24,261.00

Homogénéisateur avec option de refroidissement pour analyses génomiques

EF 2012-13

Résumé
C. Audet et R. Tremblay demandent une subvention pour l'acquisition d'un système de lyse cellulaire et d'homogénéisation sous azote liquide qui sera utilisé dans divers projets de recherche menés par les deux chercheurs et à la formation de nombreux étudiants gradués. Depuis quelques années, nous avons réorientés nos travaux pour faire de plus en plus usage des techniques de biologie moléculaire et ceci pour répondre à des objectifs de recherche en écophysiologie des bivalves et des poissons, en aquaculture et en pêche. La réalisation de ces analyses nécessite l'utilisation d'un système de lyse cellulaire de haute performance principalement pour préserver la qualité de l'ARN pour nos études en génomique. Cette problématique est particulièrement importante pour les larves d'organismes marins et pour les civelles d'anguille qui présentent des défis particuliers lors de l'homogénéisation et de l'extraction de l'ARN. De fait, nous devons faire face à trois types de défis particuliers : 1) la présence de coquilles chez les larves de bivalves qui rend très difficile l'homogénéisation et l'obtention d'ARN de qualité; 2) la très petite taille des larves d'invertébrés marins (microscopique) et des larves de poissons marins (souvent à peine 3 à 4 mm) avec lesquelles nous travaillons ne permet pas d'avoir des quantités importantes de tissus et favorise une dégradation rapide ; 3) les civelles (Anguille d'Amérique) sont plus grosses, mais ont un tégument particulièrement résistant qui oppose une résistance importante au broyage. Un système maintenant les conditions de congélation sous azote liquide durant tout le processus d'homogénéisation nous permettrait d'accroître grandement la qualité de nos échantillons. Dès son acquisition, l'appareil sera utilisé par plusieurs étudiants gradués et stagiaires postdoctoraux qui travaillent dans nos laboratoires et qui sont formés non seulement en biologie moléculaire, mais également en biochimie et en physiologie dans une approche multidisciplinaire. La formation en aquaculture et en océanographie biologique est un élément très important de la programmation scientifique de l'ISMER et notre objectif est de préparer des chercheurs qui pourront être le plus versatile et le mieux outillé possible pour répondre aux défis de demain.
Programme
Research Tools and Instruments - Category 1 (<$150,000)
Emplacement
Quebec, Canada
Type de bénéficiaire
Academia
Type
Grant
Source
NSERC's Awards Data

Tel que publié

Application id
440710-2013
Name nom
Tremblay, Rejean
Department département
Sciences de la mer de Rimouski, Institut des
Organization id
58
Institution établissement
Université du Québec à Rimouski
Province en
Québec
Province fr
Québec
Country en
CANADA
Country fr
CANADA
Fiscal year exercice financier
2012
Competition year année de concours
2013
Award amount
24261
Program id
EQPEQ
Program name en
Research Tools and Instruments - Category 1 (<$150,000)
Program name fr
Outils et instruments de recherche - catégorie 1 (<150 000$)
Group en
Discovery grants programs
Group fr
Programmes de subventions à la découverte
Committee code
1502
Committee name en
Biological Systems and Functions
Committee name fr
Systèmes et fonctions biologiques
Area of application code
106
Area of application group en
Agriculture and primary food production
Area of application group fr
Agriculture et produits alimentaires primaires
Area of application en
Aquaculture
Area of application fr
Aquiculture
Research subject code
5504
Research subject group en
Animal biology
Research subject group fr
Biologie animale
Research subject en
Animal physiology and metabolism
Research subject fr
Physiologie et métabolisme des animaux
Partie
1
Nb partie
1
Application title
Homogénéisateur avec option de refroidissement pour analyses génomiques
Keyword
NSERC
Application summary
C. Audet et R. Tremblay demandent une subvention pour l'acquisition d'un système de lyse cellulaire et d'homogénéisation sous azote liquide qui sera utilisé dans divers projets de recherche menés par les deux chercheurs et à la formation de nombreux étudiants gradués. Depuis quelques années, nous avons réorientés nos travaux pour faire de plus en plus usage des techniques de biologie moléculaire et ceci pour répondre à des objectifs de recherche en écophysiologie des bivalves et des poissons, en aquaculture et en pêche. La réalisation de ces analyses nécessite l'utilisation d'un système de lyse cellulaire de haute performance principalement pour préserver la qualité de l'ARN pour nos études en génomique. Cette problématique est particulièrement importante pour les larves d'organismes marins et pour les civelles d'anguille qui présentent des défis particuliers lors de l'homogénéisation et de l'extraction de l'ARN. De fait, nous devons faire face à trois types de défis particuliers : 1) la présence de coquilles chez les larves de bivalves qui rend très difficile l'homogénéisation et l'obtention d'ARN de qualité; 2) la très petite taille des larves d'invertébrés marins (microscopique) et des larves de poissons marins (souvent à peine 3 à 4 mm) avec lesquelles nous travaillons ne permet pas d'avoir des quantités importantes de tissus et favorise une dégradation rapide ; 3) les civelles (Anguille d'Amérique) sont plus grosses, mais ont un tégument particulièrement résistant qui oppose une résistance importante au broyage. Un système maintenant les conditions de congélation sous azote liquide durant tout le processus d'homogénéisation nous permettrait d'accroître grandement la qualité de nos échantillons. Dès son acquisition, l'appareil sera utilisé par plusieurs étudiants gradués et stagiaires postdoctoraux qui travaillent dans nos laboratoires et qui sont formés non seulement en biologie moléculaire, mais également en biochimie et en physiologie dans une approche multidisciplinaire. La formation en aquaculture et en océanographie biologique est un élément très important de la programmation scientifique de l'ISMER et notre objectif est de préparer des chercheurs qui pourront être le plus versatile et le mieux outillé possible pour répondre aux défis de demain.